Departamento de Arquitectura: Sede Salto

Departamento de Ciencias Biológicas. Sede: Salto y Paysandú

Departamento de Ciencias Sociales. Sede Salto

Departamento de Física. Sede: Salto y Paysandú

Departamento de Tecnología de los Alimentos. Sede: Paysandú

Departamento de Ingeniería Aplicada a los Procesos Agrícolas y Biológicos - Sede Paysandú 

Polo Abordaje holístico a una temática tan innovadora como preocupante: impacto de los agroquímicos sobre los productos agroalimentarios y el ambiente. Sede: Paysandú.

Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Moléculas Bioactivas Sede: Paysandú.

Laboratorio de Biomecánica y Análisis del Movimiento del Litoral. Sede: Paysandú.

Ecología Fluvial en el Centro Universitario de Paysandú. Sede: Paysandú.

Salud comunitaria. Sede: Paysandú

Laboratorio de Virología Molecular. Sede: Salto.

Departamento de Biotecnología. Sede: Salto.

Departamento de Agua y Ciencias afines. Sede: Salto. 

Centro de Artes Musicales y Escénicas en el Litoral Norte. Sede: Salto.

Departamento de Química del Litoral. Sede: Paysandú y Salto.

Departamento de Matemática y Estadística del Litoral. Sede: Paysandú y Salto.

Polo de Medicina Social. Sede: Paysandú.

Laboratorio de Energía Solar y fortalecimiento del área de Física. Sede: Salto.

Biofísicoquímica. Sede Salto

Genética Molecular Humana Sede: Salto.

Vectores y Enfermedades transmitidas en el Interior del Uruguay. Sede: Salto.

Producción y reproducción de rumiantes. Sede: Salto.

Genómica comparativa y bioinformática. Sede Salto.